مطالعه رفتار نانومکانیکی مولکول DNA تحت تأثیر نیروهای کششی | ||
| مهندسی مکانیک مدرس | ||
| Article 13, Volume 14, Issue 12, 1393, Pages 104-112 PDF (507.38 K) | ||
| Authors | ||
| مسعود طهانی* ; علی محمد ناصریان نیک | ||
| گروه مکانیک، دانشکده مهندسی، دانشگاه فردوسی مشهد | ||
| Abstract | ||
| این پژوهش قصد دارد اطلاعات جدیدی درباره رفتار مکانیکی مولکول دو رشتهای دیاِناِی ارائه دهد. به این منظور، مجموعهای از شبیهسازیهای دینامیک مولکولی توسعهیافته با جزئیات اتمی بر روی دیانای دوازده- پارهای انجام میشود. محاسبات دینامیک مولکولی با استفاده از روش حلال بُرن تعمیم یافته- مساحت سطح قابل دسترس و دینامیک لانگوینی صورت میگیرد. منحنیهای تنش- کرنش دیانای که تحت زاویهها و سرعتهای مختلف کشش به دست میآید مورد تحلیل قرار گرفته و نقش سرعت کشش و زاویه کشش در تعیین خواص بیومکانیکی دیانای دو رشتهای طول کوتاه بررسی میشود. نتایج به دست آمده نشان میدهد چقدر رفتار مولکول دی-انای تحت تأثیر نیروهای کششی میتواند پیچیده باشد. از طریق تحلیل در سطح جفت بازهای تغییر شکل مولکول، طی فرآیندهای کشش، پایداری سازهای مولکول دیان-ای-ای که در معرض کشش زاویهدار با سرعتهای کشش مختلف قرار میگیرد و نیز مسیرهای متفاوت برای جدایش دیانای دو رشتهای مطالعه میگردد. پایداری سازهای دیانای دو رشتهای میتواند وابسته به سرعت و زاویه کشش باشد. در حالی که پایداری سازهای با کاهش سرعت کشش میتواند به طور قابل ملاحظهای کاهش یابد، کشش دیانای تحت زوایای مختلف اثرات متفاوت و غیرقابل پیشبینی بر پایداری ساختار آن خواهد داشت. | ||
| Keywords | ||
| دینامیک مولکولی; دی اِن اِی (DNA) دو رشته ای; رفتار مکانیکی; کشش | ||
|
Statistics Article View: 362 PDF Download: 507 |
||
| Number of Journals | 45 |
| Number of Issues | 2,174 |
| Number of Articles | 24,685 |
| Article View | 25,104,198 |
| PDF Download | 17,787,164 |