بررسی پایداری مولکولی مهارکنندههای نسل دوم EGFR در تعامل با پروتئین نوع وحشی: یک مطالعه شبیهسازی دینامیک مولکولی | ||
| زیست فناوری | ||
| Volume 16, Issue 3 - Serial Number 46, Spring 1404, Pages 19-29 PDF (1.23 M) | ||
| Document Type: پژوهشی اصیل | ||
| DOI: 10.48311/biot.2025.27534 | ||
| Authors | ||
| سید صادق محمدی موسوی* 1; سید شهریار عرب* 2 | ||
| 1گروه بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس | ||
| 2گروه بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، | ||
| Abstract | ||
| گیرنده فاکتور رشد اپیدرمی (EGFR) یکی از مهمترین گیرندههای تیروزین کیناز است که نقش کلیدی در تنظیم فرایندهای سلولی و پیشرفت بسیاری از سرطانها از جمله سرطان ریه دارد. در این مطالعه، تأثیر مهارکنندههای نسل دوم EGFR شامل Afatinib، Dacomitinib و Neratinib و کاندیداهای دارویی Canertinib و Poziotinib بر پروتئین EGFR نوع وحشی با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی (MD) مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور، دادههای ساختاری از پایگاههای معتبر جمعآوری و تحلیل شدند. مطالعات داکینگ مولکولی به شناسایی محلهای اتصال داروها منجر گردید و شبیهسازی دینامیک مولکولی (MD) در شرایط فیزیولوژیکی، پایداری و تعاملات لیگاند-پروتئین را بررسی کرد. پارامترهای مختلفی نظیر RMSD، شعاع ژیراسیون (Rg)، SASA و پیوندهای هیدروژنی برای بررسی پایداری کمپلکسها محاسبه شدند. نتایج تحلیل MMPBSA نشان داد که Neratinib با کمترین انرژی آزاد اتصال (ΔG)، تمایل اتصال بیشتری به EGFR دارد و در طول شبیهسازی پایداری بالاتری از خود نشان داده است. همچنین، تحلیل مؤلفهی اصلی (PCA) نشان داد که کمپلکس EGFR-Neratinib دینامیک کمتری داشته و فضای فاز کمتری را اشغال میکند که نشاندهنده پایداری بیشتر این کمپلکس است. این نتایج نشان میدهد که Neratinib میتواند به عنوان قویترین مهارکننده در مقایسه با سایر ترکیبات مورد بررسی، شناخته شود و پتانسیل بالایی برای استفاده در درمانهای ترکیبی علیه EGFR دارد. | ||
| Keywords | ||
| EGFR نوع وحشی; مهارکنندههای نسل دوم EGFR; شبیهسازی دینامیک مولکولی; تحلیل MMPBSA; Neratinib | ||
| References | ||
|
| ||
|
Statistics Article View: 128 PDF Download: 46 |
||
| Number of Journals | 45 |
| Number of Issues | 2,171 |
| Number of Articles | 24,674 |
| Article View | 24,448,477 |
| PDF Download | 17,555,328 |