پیشبینی بیوانفورماتیکی توالیهای حفاظت شده میکروآرانای و مطالعه روند ایجاد و از بین رفتن آنها در بقولات | ||
| زیست فناوری | ||
| Article 4, Volume 14, Issue 1 - Serial Number 36, 1401, Pages 12-27 PDF (1.13 M) | ||
| Document Type: پژوهشی اصیل | ||
| Authors | ||
| بهزاد حاجی اقراری* 1; مجاهد کمالی زاده2 | ||
| 1عضو هیات علمی دانشکده کشاورزی دانشگاه جهرم | ||
| 2عضوهیات علمی دانشکده کشاورزی دانشگاه چهرم | ||
| Abstract | ||
| چکیده خانواده بقولات یکی از مهمترین خانوادههای گیاهان به شمار میآید. در این تحقیق توالیهای پیشساز میکروآرانای در هفت گونه از بقولات شامل Arachis hypogaea ، Glycine max، Glycine soja، Lotus japonicus، Medicago truncatula، Phaseolus vulgaris و Vigna unguiculata به شیوه جستجوی توالیهای پیشساز حامل توالیهای همولوگ میکروآرانای بالغ در میان توالیهای نسخهبرداری شونده و با در نظر گرفتن مشخصات اختصاصی توالی و ساختمان دوم توالی پیشساز در میکروآرانایهای شناسایی شده، پیش بینی و مشخصات آنها مورد توجه قرارگرفت. همچنین جایگاه ژنومی توالیهای پیشساز تعیین گردید. در این مطالعه، 414 توالی پیشساز میکروآرانای متعلق به 130 خانواده در هفت گونه مذکور که مشخصات توالی و ساختار دوم آنها با مشخصات توالی های پیشساز میکروآرانای گیاهی همخوانی داشت، پیشبینی و مشخصات آنها گزارش گردید. روابط بین گونهها براساس روند ایجاد و از بین رفتن خانوادههای میکروآرانای در هرگونه بر اساس بیشینه پارسمیونی به شیوه دولو بدست آمد و از این طریق درخت فیلوژنتیکی ارتباط گونهها ترسیم شد. خانوادههای میکروآرانای به وجود آمده و از بین رفته در گونههای مورد مطالعه در طول پیدایش و تکامل گونهها مشخص و گزارش شد. نتایج نشان داد روند ایجاد خانوادههای میکروآرانای در این خانواده اخیرا از شدت زیادی برخوردار بوده است. روابط بین گونهها بر اساس روند ایجاد و از بین رفتن خانوادههای میکروآرانای به شیوه مدل بیشینه پارسیمونی همخوانی با روابط فیلوژنی ندارد. در این مطالعه تعدادی از خانوادههای میکروآرانای به عنوان خانوادههای اختصاصی گونه و اختصاصی گروه شناسایی گردید که امکان استفاده از آنها به عنوان شناسهگر گونه/گروه وجود دارد. | ||
| Keywords | ||
| : میکروآرانای; خانواده بقولات; بیشینه پارسیمونی دولو; جستجوی توالیهای همولوگ میکروآرانای | ||
| References | ||
|
| ||
|
Statistics Article View: 198 PDF Download: 80 |
||
| Number of Journals | 45 |
| Number of Issues | 2,160 |
| Number of Articles | 24,577 |
| Article View | 20,208,283 |
| PDF Download | 16,193,674 |