پیشبینی بهترین نواحی تحریککننده سیستم ایمنی پروتئین Vif ویروس HIV در بیماران ایرانی مبتلابه ایدز | ||
| زیست فناوری | ||
| Article 1, Volume 13, Issue 3 - Serial Number 34, 1401, Pages 1-13 PDF (849.31 K) | ||
| Document Type: پژوهشی اصیل | ||
| Authors | ||
| زهرا حسن شاهی1; بهزاد دهقانی1; طیبه هاشم پور* 2 | ||
| 1مرکز تحقیقات ایدز شیراز، پژوهشکده سلامت، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران | ||
| 21. مرکز تحقیقات ایدز شیراز، پژوهشکده سلامت، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران | ||
| Abstract | ||
| ویروس HIV دارای حداقل شش ژن تنظیمی است که از بین آنها پروتئین Vif میتواند تکثیر ویروس را کنترل کند . این مطالعه برای اولین بار به بررسی جهشهای مهم در پروتئین VIF در توالیهای مربوط به بیماران ایرانی پرداخته است و با استفاده از دانش ایمونوانفورماتیک ، مناطق ثابت این پروتئین و توالیهای اپیتوپی B-Cell ، T-CELL و CTL تعیین گردید . مواد و روشها : توالیهای VIF از بانک ژنی NCBI جمعآوری گردید و از طریق نرمافزارهای بیوانفورماتیک، ساختار سوم و جایگاههای اپیتوپی B-Cell ، T-CELL و CTLآنها پیشبینی شد و خواص آنتی ژنیک و حساسیتزایی آنها موردمطالعه قرار گرفت . یافتهها : بیشترین شیوع جهشها به ترتیب مربوط به جایگاههای S 49 P ( 90% ) و S 140 N و N 186 S ( 80% ) بود. همچنین دو جابهجایی باقابلیت تأثیر در قدرت اتصال پروتئین VIF به فاکتور میزبان در جایگاههای 41 و42 در این مطالعه معرفی شدند. سه منطقه بهعنوان توالیهای اپیتوپی با تحریککنندگی بالا و حساسیتزایی کم تعیین شد که از میان آنها ناحیه 5-32 بهعنوان بهترین ناحیه برای طراحی واکسن پیشنهاد شد. نتیجهگیری: این مطالعه به عنوان اولین مطالعه از ایران با به کاربردن ابزارهای بیوانفورماتیکی یک ناحیه باقابلیت بالای تحریک سیستمهای ایمنی همورال و سلولی و همچنین کمترین خواص حساسیتزایی معرفی شد، که میتواند در مطالعات آتی در زمینه واکسنهای ضد HIV مورداستفاده قرار گیرد. | ||
| Keywords | ||
| HIV; VIF; اپی توپ; بیوانفورماتیک | ||
| References | ||
|
| ||
|
Statistics Article View: 219 PDF Download: 103 |
||
| Number of Journals | 45 |
| Number of Issues | 2,171 |
| Number of Articles | 24,674 |
| Article View | 24,548,495 |
| PDF Download | 17,592,430 |