بیگمرادی, آزاده, همایی, احمد, همتی, روح اله, صفار, بهناز (2022). آنالیز فیلوژنتیکی و بیوانفورماتیکی cDNA رمزگردان کیتیناز Fenneropenaeus mergueinsis. , 12(2), 75-90.
آزاده بیگمرادی; احمد همایی; روح اله همتی; بهناز صفار. "آنالیز فیلوژنتیکی و بیوانفورماتیکی cDNA رمزگردان کیتیناز Fenneropenaeus mergueinsis". , 12, 2, 2022, 75-90.
بیگمرادی, آزاده, همایی, احمد, همتی, روح اله, صفار, بهناز (2022). 'آنالیز فیلوژنتیکی و بیوانفورماتیکی cDNA رمزگردان کیتیناز Fenneropenaeus mergueinsis', , 12(2), pp. 75-90.
بیگمرادی, آزاده, همایی, احمد, همتی, روح اله, صفار, بهناز آنالیز فیلوژنتیکی و بیوانفورماتیکی cDNA رمزگردان کیتیناز Fenneropenaeus mergueinsis. , 2022; 12(2): 75-90.

آنالیز فیلوژنتیکی و بیوانفورماتیکی cDNA رمزگردان کیتیناز Fenneropenaeus mergueinsis

زیست فناوری
Article 6, Volume 12, Issue 2 - Serial Number 29, 1400, Pages 75-90    PDF (1.21 M)
Document Type: پژوهشی اصیل
Authors
آزاده بیگمرادی1; احمد همایی* 1; روح اله همتی2; بهناز صفار2
1دانشگاه هرمزگان
2دانشگاه شهرکرد
Abstract
کیتینازها جزء آنزیم های ضروری سخت پوستان می باشند که در چرخه پوست اندازی و هضم کیتین نقش مهمی ایفا میکنند. بر اساس مطالعه حاضر، cDNA رمزگردان کیتیناز از Penaeus mergueinsis با طول bp 1440 شامل 467 اسید آمینه با روش PCR تعیین توالی و سپس آنالیز فیلوژنیکی و بیوانفورماتیکی آن انجام شد. توالی جدید در بانک ژنی با شماره دستیابی MT250539ثبت شد و وزن مولکولی پروتئین حاصل از این توالی KDa 51.84 و نقطه ایزوالکتریک تئوریکال 4.79 تخمین زده شد. مقایسه توالی آمینواسیدی در بین کیتینازهای پنائید بیشترین شباهت (حدود 97 تا 92 %) به ترتیب با P. mondon chi-3، F. chinensis، P. vannamei و P. japonicus chi-3 نشان داد. بررسی های فیلوژنتیکی نشان داد که کیتیناز مطالعه حاضر متعلق به کیتینازهای گروه 3 می­باشد. آنالیزهای الگوی پروتئینی آشکار شده نشان داد که کیتیناز P. mergueinsis شامل دمین کاتالیتیکی Glyco-18 در موقعیت 2-347، یک جایگاه متصل شونده به کیتین پریتروفین A در موقعیت 403-456، یک پل دی سولفیدی شکل گرفته توسط دو سیستئین در موقعیت 421- 436، یک دمین متصل شونده به کیتین نوع 2، جایگاه فعال (117FDGLDMDWE125)، یک ناحیه غنی از پرولین / ترئونین در موقعیت های 376-412 و یک جایگاه مفروض N – گلیکوزیلاسیون در موقعیت 424- 427 (NTSG) می باشد. مطالعه حاضر نشان می­دهد که توالی P. mergueinsis حاوی موتیف های کیتیناز فعال و مشابه کیتینازهایی است که قبلا تعیین توالی شده اند و درصورت کلونیگ، بیان و تخلیص احتمالا ویژگی های کارکردی و ساختاری مشابه آنزیم های گونه های مورد اشاره بالا را دارد.
Keywords
کیتیناز; فیلوژنی; Penaeus mergueinsis; بیوانفورماتیک; CDNA
References
Statistics
Article View: 210
PDF Download: 83
Statistics
Number of Journals45
Number of Issues2,160
Number of Articles24,577
Article View19,959,628
PDF Download16,091,015