مرتضوی, صدیقه سادات, غربی*, صدیقه, شاه علی*, مریم (2020). پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی. , 12(1), 89-101.
صدیقه سادات مرتضوی; صدیقه غربی*; مریم شاه علی*. "پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی". , 12, 1, 2020, 89-101.
مرتضوی, صدیقه سادات, غربی*, صدیقه, شاه علی*, مریم (2020). 'پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی', , 12(1), pp. 89-101.
مرتضوی, صدیقه سادات, غربی*, صدیقه, شاه علی*, مریم پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی. , 2020; 12(1): 89-101.

پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی

زیست فناوری
Article 7, Volume 12, Issue 1 - Serial Number 28, 1399, Pages 89-101    PDF (780.23 K)
Document Type: پژوهشی اصیل
Authors
صدیقه سادات مرتضوی1; صدیقه غربی*2; مریم شاه علی** 3
1ﮔﺮوه زیست ﺷﻨﺎﺳﯽ، دانشکده علوم پایه،دانشگاه شهید باهنر کرمان
2ﮔﺮوه زیست ﺷﻨﺎﺳﯽ، دانشکده علوم پایه،دانشگاه شهید باهنر کرمان ، Gharbi@uk.ac.ir
3بخش کنترل کیفیت، مجتمع تولیدی تحقیقاتی انستیتو پاستور ایران
Abstract
هدف: EMT فرایندی برگشت­پذیر و ضروری در طول جنین‌زایی، بهبود زخم و پیشرفت سرطان است. در بسیاری از سرطان‌ها، EMT می‌تواند ویژگی­های تهاجمی تومور را افزایش دهد. اخیراً miRNAها به‌عنوان کلاس جدیدی از‌RNA های غیر کدکننده­ تنظیم­گر بیان ژن در مراحل پس از ترجمه دخیل در فرایندEMT شناخته می­شوند. بـااین‌حال، مکانیسم و اثر دقیق miRNAها در فرایند EMT در سلول‌های سرطانی انسان هنوز به‌خوبی مشخص نیست. این مطالعه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک پیش‌بینی‌کننده miRNAهای تنظیم‌کننده ژن‌های اصلی در فرایندEMT ، تلاش می‌کند نقش miRNAها را در فرایند EMT روشن کند.

مواد و روش‌ها: در این مطالعه، با استفاده از پایگاه‌های داده­های تحت وب و ابزارهای پیش‌بینی برهم‌کنش miRNAها نظیر DIANA، TargetScan و miRSystem، برهم‌کنشmiRNAهای تنظیم‌کننده ژن­های N-cadherin ، TWIST1، ZEB1، SNAIL و Vimentin به عنوان بیومارکرهای اصلی سلول‌های مزانشیمی بررسی شد.

نتایج: اثرات miRNAهای متفاوت براساس الگوریتم هر پایگاه بر ژن‌های نامزد بررسی و داده‌های به‌دست‌آمده از پایگاه‌های مختلف باهم اشتراک گرفته شد. نتایج نشان داد که یازده miRNA با احتمال بالا به‌طورمشترک می­توانند در فرایند EMT/MET نقش داشته باشند.

ﻧﺘﯿﺠﻪ‌ﮔﯿﺮی: براساس یافته‌های ما، می­توان پیش‌بینی کرد که با توجه به نمره بالاmiRNA های انتخاب‌شده با ژن‌های نامزد، این miRNAها می­توانند نقشی مهم در فرایند EMT/MET داشته باشد. ازاین‌رو، می‌توان از آنها به‌عنوان کاندیدهای مناسب برای تحقیقات بالینی آینده استفاده کرد.



کلمات کلیدی: EMT،MET ، TargetScan، miRSystem، microRNA
Keywords
EMT; MET; TargetScan; miRSystem; microRNA
References
Statistics
Article View: 205
PDF Download: 99
Statistics
Number of Journals45
Number of Issues2,171
Number of Articles24,674
Article View24,436,041
PDF Download17,551,293