بررسی تنوع پروکاریوتهای اکوسیستم شور به روش غیرقابل کشت | ||
| زیست فناوری | ||
| Article 18, Volume 9, Issue 1 - Serial Number 16, 1396, Pages 137-144 PDF (1003.84 K) | ||
| Authors | ||
| فرشته جوکار کاشی* 1; پرویز اولیا2; محمدعلی آموزگار3 | ||
| 1گروه بیوتکنولوژی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، کاشان، ایران | ||
| 2مرکز تحقیقات میکروبشناسی ملکولی، دانشگاه شاهد، تهران ،ایران | ||
| 3گروه میکروبیولوژی، دانشکده زیستشناسی و قطب تبارزایی موجودات زنده، دانشگاه تهران، تهران، ایران | ||
| Abstract | ||
| اهداف: میکروارگانیزمها علاوه بر محیطهای معمولی در محیطهای افراطی هم حضور دارند. دریاچههای نمک با شوری در حد اشباع در سراسر جهان پراکنده هستند. یکی از این محیطهای پرشور دریاچه ارومیه است. هدف مطالعه حاضر بررسی تنوع پروکاریوتهای اکوسیستم شور دریاچه ارومیه به روش غیرقابل کشت بود. مواد و روشها: در پژوهش تجربی حاضر از مناطق مختلف دریاچه ارومیه نمونهبرداری شد و ماده ژنومی استخراجشده از نمونه آب شاخص بهعنوان الگو برای تکثیر قطعه ۱۶S rDNA و قطعهای از ژن bop از طریق واکنش زنجیرهای پلیمراز مورد استفاده قرار گرفت. با روش کلونینگ هر یک از قطعات تکثیرشده که مربوط به یک سویه منفرد بودند توسط کیت T/A وکتور تکثیر یافتند. برای بررسی بیشتر تنوع زیستی هالوآرکیها بهموزات بررسی ۱۶S rDNA، تنوع زیستی ژن bop نیز مطالعه شد. یافتهها: با روش کلونینگ و توالییابی شش جنس باکتری شامل آکاریوکلوریس، ادهیریباکتر، براکیباکتریوم، گلوئوکپسوپسیز، سیزریباکتر و باسیلوس شناسایی شدند. کتابخانه ژنی آرکیها متعلق به پنج جنس شامل هالونوتیوس، هالولامینا، هالوکوادراتوم، هالومیکروآرکولا و هالورهابدوس بودند. کتابخانه کلونهای باکتریایی نیز در چهار راسته باکتریوئیدز، سیانوباکتر، اکتینوباکتر و فرمیتیکوس قرار داشتند. کلونهای کتابخانه قطعهای از ژن bop (به عنوان یک مارکر مولکولی) متعلق به چهار جنس شامل هالوروبروم، نتریآلبا، هالوکوادراتوم و نترینما بودند. فیلوژنی bop با فیلوژنی ۱۶S rDNA رابطه تنگاتنگی نشان داد. نتیجهگیری: با روش کلونینگ و توالییابی شش جنس باکتری شامل آکاریوکلوریس، ادهیریباکتر، براکیباکتریوم، گلوئوکپسوپسیز، سیزریباکتر و باسیلوس شناسایی شدند. فیلوژنی bop با فیلوژنی ۱۶S rDNA رابطه تنگاتنگی دارد. | ||
| Keywords | ||
| محیط پرشور; ژن bop; متاژنوم; هالوآرکی | ||
| References | ||
|
| ||
|
Statistics Article View: 198 PDF Download: 86 |
||
| Number of Journals | 45 |
| Number of Issues | 2,160 |
| Number of Articles | 24,572 |
| Article View | 19,840,311 |
| PDF Download | 16,027,240 |