پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی با استفاده از پروفایل انرژی | ||
| زیست فناوری | ||
| Article 4, Volume 1, Issue 1, 1389, Pages 1-10 PDF (373.12 K) | ||
| Authors | ||
| سید شهریار عرب* 1; مهدی صادقی2; چنگیز اصلاح چی3; حمید پزشک4 | ||
| 1نیاوران - میدان شهید باهنر - پژوهشگاه تحقیقات بنیادی (IPM) - پژوهشکده کامپیوتر - گروه بیوانفورماتیک | ||
| 2اتوبان تهران - کرج - پژوهشگاه ژنتیک - صندوق پستی ۱۴۱۵۵-۶۳۴۳ | ||
| 3دانشگاه شهید بهشتی دانشکده ریاضی صندوق پستی ۱۹۸۳۹۶۳۱۱۳ | ||
| 4دانشگاه تهران، دانشکده ریاضی آمار و علوم کامپیوتر، قطب بیومت | ||
| Abstract | ||
| در این مقاله پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی بر پایه توالی اسید های آمینه آن ارائه خواهد شد. برای تعریف فاکتوری به منظور تشخیص میزان انعطاف پذیری از انرژی دو اسید آمینه متوالی استفاده شد. با استفاده از تحلیل های آماری برروی این انرژی، عددی بین صفر و صد به هر جفت اسید آمینه تعلق می‌گیرد که آنرا عدد انعطاف پذیری می نامیم. در نظر گرفتن اثرات همسایه ها تا چهار همسایه اسید آمینه باعث بهبود پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئین می‌گردد. برای ارزیابی پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی از پروتئین هایی که ساختمان آنها توسط NMR تعیین ساختار شده بود استفاده شد. عدم قطعیت در تعیین ساختار مناطقی که انعطاف پذیری بالایی دارند، مثل سر و ته زنجیره و حلقه‌ها باعث ایجاد مدل‌های مختلف ساختمانی می‌شود. مقایسه بین پیشگویی و پراکندگی زوایا در مدل‌های مختلف همبستگی بالایی را نشان می‌دهد که حاکی از دقت قابل اعتماد روش پیشگویی می‌باشد. | ||
| Keywords | ||
| انعطاف پذیری ساختمانی; پیشگویی عملکرد پروتئین; پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئین; پیشگویی ساختمان پروتئین | ||
|
Statistics Article View: 145 PDF Download: 29 |
||
| Number of Journals | 45 |
| Number of Issues | 2,154 |
| Number of Articles | 24,478 |
| Article View | 10,457,539 |
| PDF Download | 5,933,136 |