متاآمیکس، رویکردی نوین برای شناخت محیطزیست پیرامون ما | ||
| زیست فناوری | ||
| Article 1, Volume 13, Issue 2 - Serial Number 33, 1401, Pages 1-30 PDF (493.93 K) | ||
| Document Type: مروری تحلیلی | ||
| Authors | ||
| محمدحسین همتجو1; داود نامدار خجسته* 2; آرزو طهمورث پور3; اصغر میرزایی اصل4 | ||
| 1گروه علوم و مهندسی خاک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدان. | ||
| 2گروه علوم و مهندسی خاک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران. | ||
| 3گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد اصفهان (خوراسگان)، ایران. | ||
| 4همدان | ||
| Abstract | ||
| شمار سلولهای میکروبی در سیارهی زمین از ستارههایی که در کهکشانها میشناسیم، بسیار بیشتر است. گوناگونی میکروبی و شبکهی بومشناختی آنها با اینکه کارکردهای ویژهای در زیستبومهای کرهی زمین دارند، ناشناخته مانده است. فناوریهای آمیکس مانند متاژنومیکس ابزارهایی را برای شناخت بخش بزرگی از این نادیدهها با دقت زیادی فراهم نمودهاند که ژرفای آگاهیهایی که نسبت به آنچه از روشهای مبتنی بر کشت میکروارگانیسمها بهدست میآید، بسیار بیشتر است. یک نمونه در مورد گوناگونی ومپایرلیدسها است که از آغازیان و یوکاریوتهای میکروسکوپی هستند. روشهای متاآمیکس آشکار کردهاند که گوناگونی درون این گروه از میکروارگانیسمها با گوناگونی همهی سلسلهی قارچها برابری میکند. آنها در هر گوشهای از طبیعت، از اقیانوسها گرفته تا خاکها یافت میشوند و تنها یکی از هفت گروه آغازیان هستند. در این مقاله افزون بر آشنایی با فناوریهای آمیکس به پروژههای کلان در این زمینه نیز پرداخته شده است تا دستاوردهای آنها برای شناخت میکروارگانیسمها و کارکرد آنها ارائه گردد. در متاژنومیکس توالییابی مستقیم و شناسایی ژنها و ژنومهای موجود در زیستبومهای پیچیدهی میکروبی انجام میگیرد. ویرومیکس پژوهش بر روی متاژنومهای ویروسی است. در متاترانسکریپتومیکس mRNA مورد آنالیز قرار میگیرد که به دلیل ناپایدار بودن آن در نمونههای زیستمحیطی، گردآوری و رمزگشایی از آن چالش اصلی این آمیکس است. شناسایی و اندازهگیری پروتئینهای گوناگون که میتواند مستقیما فعالیت میکروبی را اندازهگیری نماید در متاپروتئومیکس انجام میشود. متابولومیکس زیستمحیطی مطالعهی متابولیتهای مولکولی با وزن کم تولید شده از برهمکنشهای میان میکروارگانیسمها همانند یوکاریوتهای کوچک، گیاهان، جانوران، شکارچیان و تنشهای غیرزنده و دیگر محرکها است. | ||
| Keywords | ||
| متاآمیکس; متاژنومیکس; ویرومیکس; متاترانسکریپتومیکس; متاپروتئومیکس; متابولومیکس و گوناگونی میکروبی | ||
| References | ||
|
| ||
|
Statistics Article View: 257 PDF Download: 168 |
||
| Number of Journals | 45 |
| Number of Issues | 2,174 |
| Number of Articles | 24,685 |
| Article View | 25,081,866 |
| PDF Download | 17,779,728 |